メモ: WSLでcondaをインストール

2021-06-13 Tips

ことのアラマシ

FDTD法という電磁波シミュレーションしたい
↓
高額なソフトが必要
↓
MEEPというフリーソフトで可能
↓
MEEPはLinux or Mac環境でしか動作しないらしい…

ということでLinux環境をWindows上に構築する必要が生じました。
最近は便利なものでWindows Subsystem for Linux（WSL）というMicrosoft謹製ツールが配布されており，手軽にLinux環境が構築できるとのこと。
~~いまにして思えばこれを鵜呑みにしたのが良くなかったような…~~

導入手順

導入自体はMEEPの公式ドキュメントで説明されている。

まずはパッケージ管理ツールminicondaを導入する

wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -O miniconda.sh
bash miniconda.sh -b -p <desired_prefix>
export PATH=<desired_prefix>/bin:$PATH

condaでpymeepを導入する。

conda create -n mp -c conda-forge pymeep

ところが，2手目の

bash miniconda.sh -b -p

がうまくいかなかった。

OSError: [Errno 40] Too many levels of symbolic links:

原因がよくわからず2週間を費やした（さすがにこればっかりやってたわけじゃないけど…）。

解決

調べても情報があまり出てこなくて時間を費やした。
結局のところWSL上でAnacondaを入れようとしたときに発生する不具合のようだった（たぶん）。
Githubでタイムリーなissueが立っていて，これを参考に解決に至った。

あとはこのissueに追記した通り。
原因は

pkgs/ncurses-6.2-h58526e2_4/share/terminfo/N/ncr260vt300wpp
pkgs/ncurses-6.2-h58526e2_4/share/terminfo/E/Eterm

で，これらに含まれるリンクが良くないとのこと。
issue #10333 (comment)では別途ncursesパッケージをAnacondaのページから拾ってきて上記2ファイルを差し替えれば良いとのことだったが，これでは解消しなかった。
渡邉の環境ではリンク先である

miniconda3/share/terminfo/N/ncr260vt300wpp

をコピーしてきて

pkgs/ncurses-6.2-h58526e2_4/share/terminfo/N/ncr260vt300wpp

を置き換えたところminicondaのインストールが成功した
(Etermのファイルサイズが違うぞって怒られたけど無視)。